一、标本的采集
（一）患者标本的采集。
急性期血清：发病1周内，无菌静脉采集非抗凝血5ml。
恢复期血清：发病后2至 3周或以上，无菌静脉采集非抗凝血5ml。
（二）伊蚊标本的采集。
在本病暴发或流行期间，采集疫点的伊蚊成蚊和幼虫，用于病原学检测。
二、标本的保存与运输
血液标本采集后，在4℃条件下尽快运送至实验室进行血清分离并保存。
血清标本可置于-20℃冰箱短期保存，长期保存须置-70℃以下。
标本运输按照卫生部《人间传染的病原微生物名录》的规定执行。
三、检测方法
常用检测方法主要有3种：血清学检测、核酸检测和病毒分离。一般情况下，病毒分离与核酸检测宜采用发病后1周内的血清； IgM抗体检测宜采用发病4天后的血清，IgG抗体的检测宜采用发病1周后的血清。
（一）血清学检测方法。
特异性IgM检测。
采用的方法有：捕获ELISA法（MacELISA）、间接ELISA法、免疫荧光法和免疫层析法等。
特异性IgG检测。
采用的方法有：间接ELISA法、免疫荧光法和免疫层析法等。
意义
（1）IgM阳性结果，表明患者新近CHIKV感染，用于基孔肯雅热早期诊断。
（2）IgG阳性结果，表明曾受到CHIKV感染；恢复期血清抗体滴度比急性期抗体滴度有4倍或4倍以上升高则可确诊。
（二）病原学检测方法。
基孔肯雅病毒核酸检测。
一般发病后7日内在多数患者的血清中可检测到病毒核酸。冻存伊蚊标本也可进行基孔肯雅病毒核酸检测。可采用RT-PCR和Real-time RT-PCR等核酸扩增的方法检测。
病毒分离鉴定。
常用Vero、C6/36等敏感细胞系开展病毒分离，分离物可以免疫荧光法或核酸检测进行鉴定。
意义。
患者血清中分离到基孔肯雅热病毒和/或检测到病毒核酸后，可确诊基孔肯雅热病毒感染。
